Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RarbP22605 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RarbP22605 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RarbP22605 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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