Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ccm2-203ENSMUST00000109722 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Defa-rs1P17533 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms