Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tgfb3P17125 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms