Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Rps25-201ENSMUST00000080300 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Irf1P15314 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Irf1P15314 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Irf1P15314 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Irf1P15314 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Irf1P15314 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Irf1P15314 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Irf1P15314 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms