Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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SrgnP13609 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SrgnP13609 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrgnP13609 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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SrgnP13609 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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SrgnP13609 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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SrgnP13609 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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SrgnP13609 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SrgnP13609 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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