Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DmdP11531 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DmdP11531 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DmdP11531 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DmdP11531 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
DmdP11531 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DmdP11531 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
DmdP11531 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DmdP11531 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
DmdP11531 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
DmdP11531 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DmdP11531 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DmdP11531 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
DmdP11531 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
DmdP11531 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DmdP11531 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
DmdP11531 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
DmdP11531 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
DmdP11531 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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DmdP11531 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
DmdP11531 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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DmdP11531 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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DmdP11531 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
DmdP11531 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
DmdP11531 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
DmdP11531 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
DmdP11531 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
DmdP11531 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
DmdP11531 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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DmdP11531 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
DmdP11531 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
DmdP11531 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
DmdP11531 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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DmdP11531 CT571271.1-201ENSMUST00000227071 670 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
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DmdP11531 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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DmdP11531 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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DmdP11531 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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DmdP11531 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm17836-201ENSMUST00000191976 1302 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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DmdP11531 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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DmdP11531 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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DmdP11531 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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DmdP11531 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
DmdP11531 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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