Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ifna9P09235 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms