Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2-Eb1P04230 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms