Protein–RNA interactions for Protein: P00375

Dhfr, Dihydrofolate reductase, mousemouse

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Length 187 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhfrP00375 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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DhfrP00375 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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DhfrP00375 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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DhfrP00375 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
DhfrP00375 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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