Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ldb2O55203 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ldb2O55203 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ldb2O55203 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms