Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm26780-201ENSMUST00000180748 2495 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gys1-201ENSMUST00000003964 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm38054-201ENSMUST00000192380 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ptpn20O55082 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms