Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
DffaO54786 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DffaO54786 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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DffaO54786 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DffaO54786 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
DffaO54786 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DffaO54786 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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DffaO54786 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
DffaO54786 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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DffaO54786 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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DffaO54786 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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DffaO54786 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DffaO54786 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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DffaO54786 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DffaO54786 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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DffaO54786 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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DffaO54786 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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DffaO54786 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
DffaO54786 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DffaO54786 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
DffaO54786 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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