Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
BC117090L7N257 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
BC117090L7N257 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms