Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm3542K7N6U2 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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