Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm2056J3QQ02 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 530.7 ms