Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm8888J3QPX5 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms