Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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BC024978J3QPC3 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC024978J3QPC3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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BC024978J3QPC3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
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BC024978J3QPC3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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BC024978J3QPC3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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BC024978J3QPC3 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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BC024978J3QPC3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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BC024978J3QPC3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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BC024978J3QPC3 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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BC024978J3QPC3 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
BC024978J3QPC3 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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