Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smim18J3QNP2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.4 ms