Protein–RNA interactions for Protein: J3QMH4

Gm21866, Predicted gene, 21866, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21866J3QMH4 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm21866J3QMH4 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms