Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Taf4bG5E8Z2 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms