Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smok3bC0HKC9 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smok3bC0HKC9 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smok3bC0HKC9 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smok3bC0HKC9 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smok3bC0HKC9 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smok3bC0HKC9 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smok3bC0HKC9 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smok3bC0HKC9 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smok3bC0HKC9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smok3bC0HKC9 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smok3bC0HKC9 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smok3bC0HKC9 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smok3bC0HKC9 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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