Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmf1B9EKI3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms