Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
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Phf11bB4XVQ1 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
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Phf11bB4XVQ1 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Phf11bB4XVQ1 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Phf11bB4XVQ1 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Phf11bB4XVQ1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Phf11bB4XVQ1 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
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