Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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Rd3lB2RV38 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Rd3lB2RV38 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Rd3lB2RV38 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Rd3lB2RV38 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rd3lB2RV38 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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