Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PtprbB2RU80 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PtprbB2RU80 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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PtprbB2RU80 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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PtprbB2RU80 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms