Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Rrn3B2RS91 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rrn3B2RS91 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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