Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Gm5738-201ENSMUST00000206016 779 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 CT030035.1-201ENSMUST00000223964 935 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NhsB1AV60 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms