Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gm5684-201ENSMUST00000198419 961 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm5725-201ENSMUST00000105195 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Vmn1r129-201ENSMUST00000165961 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm8720-201ENSMUST00000168392 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm6558-203ENSMUST00000195395 612 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm5307-201ENSMUST00000204772 760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 AC154219.1-201ENSMUST00000220764 1262 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Olfr199-201ENSMUST00000099657 931 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prr29B1ARI9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm2814-201ENSMUST00000207074 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prr29B1ARI9 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms