Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
SktA2AQ25 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
SktA2AQ25 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms