Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Robo3Q9Z2I4 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Robo3Q9Z2I4 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Robo3Q9Z2I4 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Robo3Q9Z2I4 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Robo3Q9Z2I4 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Robo3Q9Z2I4 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Robo3Q9Z2I4 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Robo3Q9Z2I4 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Robo3Q9Z2I4 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Robo3Q9Z2I4 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Robo3Q9Z2I4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Robo3Q9Z2I4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Robo3Q9Z2I4 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Robo3Q9Z2I4 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Robo3Q9Z2I4 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Robo3Q9Z2I4 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Robo3Q9Z2I4 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Robo3Q9Z2I4 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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