Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Cldn8Q9Z260 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms