Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sema6cQ9WTM3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms