Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gpc6Q9R087 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gpc6Q9R087 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Gpc6Q9R087 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gpc6Q9R087 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gpc6Q9R087 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gpc6Q9R087 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gpc6Q9R087 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gpc6Q9R087 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Gpc6Q9R087 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gpc6Q9R087 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Gpc6Q9R087 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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