Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
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ChmQ9QXG2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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ChmQ9QXG2 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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ChmQ9QXG2 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
ChmQ9QXG2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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