Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Col5a3Q9JLI2 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Col5a3Q9JLI2 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Col5a3Q9JLI2 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col5a3Q9JLI2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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