Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tlr5Q9JLF7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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