Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Trim39Q9ESN2 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Trim39Q9ESN2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Trim39Q9ESN2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Trim39Q9ESN2 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trim39Q9ESN2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trim39Q9ESN2 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trim39Q9ESN2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trim39Q9ESN2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Trim39Q9ESN2 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Trim39Q9ESN2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms