Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Cmtm7Q9ESD6 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cmtm7Q9ESD6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms