Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Med27Q9DB40 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Med27Q9DB40 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Med27Q9DB40 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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Med27Q9DB40 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Med27Q9DB40 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Med27Q9DB40 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Med27Q9DB40 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Med27Q9DB40 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Med27Q9DB40 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Med27Q9DB40 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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Med27Q9DB40 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms