Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Cab39lQ9DB16 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
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Cab39lQ9DB16 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Cab39lQ9DB16 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39lQ9DB16 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms