Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SlirpQ9D8T7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms