Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gtf3c6Q9D8P7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gtf3c6Q9D8P7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gtf3c6Q9D8P7 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gtf3c6Q9D8P7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Gtf3c6Q9D8P7 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Gtf3c6Q9D8P7 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Gtf3c6Q9D8P7 Kirrel3-205ENSMUST00000187182 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37389-201ENSMUST00000194885 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Gtf3c6Q9D8P7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Gtf3c6Q9D8P7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Gtf3c6Q9D8P7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Gtf3c6Q9D8P7 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gtf3c6Q9D8P7 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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