Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gabra4Q9D6F4 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms