Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pramef12Q9D2F1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pramef12Q9D2F1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms