Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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Susd3Q9D176 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Susd3Q9D176 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Susd3Q9D176 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Susd3Q9D176 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Susd3Q9D176 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Susd3Q9D176 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Susd3Q9D176 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Susd3Q9D176 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Susd3Q9D176 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Susd3Q9D176 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Susd3Q9D176 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Susd3Q9D176 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Susd3Q9D176 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Susd3Q9D176 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Susd3Q9D176 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Susd3Q9D176 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Susd3Q9D176 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Susd3Q9D176 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd3Q9D176 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Susd3Q9D176 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd3Q9D176 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Susd3Q9D176 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd3Q9D176 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Susd3Q9D176 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Susd3Q9D176 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Susd3Q9D176 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd3Q9D176 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Susd3Q9D176 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Susd3Q9D176 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Susd3Q9D176 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Susd3Q9D176 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Susd3Q9D176 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Susd3Q9D176 Clec1b-201ENSMUST00000032262 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd3Q9D176 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Susd3Q9D176 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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