Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Mms19Q9D071 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Mms19Q9D071 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Mms19Q9D071 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Mms19Q9D071 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Mms19Q9D071 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Mms19Q9D071 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Mms19Q9D071 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Mms19Q9D071 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Mms19Q9D071 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Mms19Q9D071 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Mms19Q9D071 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Mms19Q9D071 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Mms19Q9D071 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Mms19Q9D071 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mms19Q9D071 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mms19Q9D071 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mms19Q9D071 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mms19Q9D071 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mms19Q9D071 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mms19Q9D071 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mms19Q9D071 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mms19Q9D071 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mms19Q9D071 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mms19Q9D071 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mms19Q9D071 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mms19Q9D071 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Mms19Q9D071 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mms19Q9D071 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mms19Q9D071 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Mms19Q9D071 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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Mms19Q9D071 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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