Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX47

Xrcc2, DNA repair protein XRCC2, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc2Q9CX47 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Xrcc2Q9CX47 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Xrcc2Q9CX47 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Xrcc2Q9CX47 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Xrcc2Q9CX47 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Xrcc2Q9CX47 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Xrcc2Q9CX47 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Xrcc2Q9CX47 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Xrcc2Q9CX47 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Xrcc2Q9CX47 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Xrcc2Q9CX47 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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