Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prkrip1Q9CWV6 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms