Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Zfp943-201ENSMUST00000055349 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Pfdn1Q9CWM4 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Pfdn1Q9CWM4 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Pfdn1Q9CWM4 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Pfdn1Q9CWM4 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Pfdn1Q9CWM4 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Pfdn1Q9CWM4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Pfdn1Q9CWM4 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn1Q9CWM4 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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