Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Atxn3Q9CVD2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atxn3Q9CVD2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atxn3Q9CVD2 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atxn3Q9CVD2 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atxn3Q9CVD2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atxn3Q9CVD2 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atxn3Q9CVD2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atxn3Q9CVD2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn3Q9CVD2 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn3Q9CVD2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn3Q9CVD2 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn3Q9CVD2 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn3Q9CVD2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Atxn3Q9CVD2 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Atxn3Q9CVD2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Atxn3Q9CVD2 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn3Q9CVD2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Atxn3Q9CVD2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Atxn3Q9CVD2 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn3Q9CVD2 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn3Q9CVD2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn3Q9CVD2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Atxn3Q9CVD2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Atxn3Q9CVD2 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn3Q9CVD2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Atxn3Q9CVD2 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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